Ancestry dependent gene expression correlates with reprogramming to pluripotency and multiple dynamic biological processes
人工多能性幹細胞（iPSC）は分化した細胞に由来することができ、患者由来のiPSCを疾患関連細胞株に分化させることにより、個別化された疾患モデルの生成を可能にします。異なるiPSC系統間の遺伝的変動は分化能に影響を及ぼしますが、体細胞におけるこの変動が多能性細胞にどのように影響するかはあまり理解されていません。リプログラミング効率の一貫した変動を伴う72の皮膚線維芽細胞iPSCペアからトランスクリプトームデータを生成して比較しました。自己申告のアフリカ系アメリカ人と白人アメリカ人からの同数のサンプルを検討することにより、再プログラミング効率に関連する祖先依存および祖先非依存の両方の転写産物を特定し、トランスクリプトームの不均一性が実質的に再プログラミングに影響を与える可能性があることを示唆しました。さらに、再プログラミング効率関連遺伝子は、癌や創傷治癒を含む多様な動的生物学的プロセスに関与しており、独立したコホートでの5年間の乳癌生存を予測します。候補遺伝子は、細胞運命遷移の祖先依存性調節のメカニズムへの洞察を提供し、再プログラミングの改善のための追加の研究を動機付ける可能性があります。
advances.sciencemag.org/cgi/content/short/6/47/eabc3851
2020/11/20
Science2584
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