Genetic interaction mapping informs integrative structure determination of protein complexes
タンパク質複合体の構造を決定することは、細胞機能を理解するために重要です。ここでは、遺伝的相互作用のinvivo測定に依存する統合構造決定アプローチについて説明します。遺伝子欠失に対して交差した、または環境の摂動にさらされた点突然変異の表現型プロファイルを構築し、続いて2つのプロファイル間の類似性を突然変異した残基間の距離の上限に変換します。 350の変異体の約500,000の遺伝的相互作用に基づいて、酵母ヒストンH3-H4複合体の構造を決定します。次に、この方法を酵母RNAポリメラーゼIIのサブユニットRpb1-Rpb2と細菌RNAポリメラーゼのサブユニットRpoB-RpoCに適用します。精度は、化学的架橋に基づく精度に匹敵します。遺伝的相互作用とクロスリンクの両方からの拘束を使用すると、モデルの精度と精度がさらに向上します。このアプローチは、invivo観察で統合構造決定を強化するための効率的な手段を提供します。
science.sciencemag.org/cgi/content/short/370/6522/eaaz4910
2020/12/10
Science3050
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